全市人民关注的沪通铁路已经获准建设。根据规划，沪通铁路的线路走向像向右倾倒的字母“Y”，自宁启铁路(南京－启东)平东站引出，沿九圩港西侧至南通捕鱼港附近跨越长江至张家港市，往东经常熟、太仓，在太仓分出两支，一支往南接入京沪铁路安亭站，另一支继续往东经杨行进入宝山、浦东，直接联通浦东国际机场。
沪通铁路南通至上海安亭段目前已敲定9个站，江苏境内分别是平东、南通西、张家港北、张家港、常熟、太仓港、太仓7个站，上海境内有安亭、黄渡2个站。按照规划，沪通铁路设计时速为160－200公里，预计2020年前建成。建成后，将开行动车组列车，届时从南通到上海只需1小时左右。
在我国的《中长期铁路网规划》中，沿海铁路是东部沿海地区一条重要的铁路大动脉，它由辽东半岛出发经渤海至山东半岛再沿着海岸线直抵珠江三角洲。在这条大动脉上，目前甬台温铁路(宁波－台州－温州)、温福铁路(温州－福州)、福厦铁路(福州－厦门)、沪杭城际铁路(上海－杭州)已建成通车。而北接新长铁路(新沂至长兴)、连盐铁路以及青连铁路(青岛－连云港)的沪通铁路一旦开通，则将打通沿海铁路大动脉上的关键“节点”，实现长江南北的铁路贯通。届时，不仅连云港到上海的时间能减少一半，整个山东半岛到上海的距离都将大大缩短。
