由于集装箱市场的不景气，中国远洋和中海集运2009年出现巨亏。中国远洋亏损75.4亿元，中海集运亏损64.89亿元，在已经公布年报的上市公司中，两者的亏损额度分别占据前两名位置。
不过，中国远洋认为，公司的集装箱运输业务单元2010年有望扭亏。根据航运研究机构Drewy预测，2010年全球集运价格有望上涨30％，班轮业整体将出现盈利。由于今年宏观经济止跌回升，退役及延期交付力度有所加大，行业自律行为明显加强，因此公司对2010年集运业务今年扭亏较有信心。
2009年，中国远洋实现营业收入557.3亿元，同比下降51.9％；利润总额-61.3亿元，同比下降142.5％；归属于上市公司股东的净利润-74.5亿元，同比下降169.9％。从业务单元来看，集装箱业务对公司整体业务利润的拖累尤为显著。
中国远洋总经理张良表示，“2009年集装箱市场供大于求，量价持续下跌，中国出口集装箱指数相比2008年同期下降了21.6％。”
中海集运年报也显示，公司去年实现营业收入199.38亿元，同比减少43.44%；归属于上市公司股东的净利润为-64.89亿元，同比大幅下滑4917.73%；每股收益为-0.56元，同比减少4929.57%；加权平均净资产收益率为-22.78%。