在新冠病毒传染病的疫苗供应成为今后课题的情况下，日本机场运营方和航空运输企业正在强化相关体系。成田和关西两座机场取得了国际业界团体设定的医药品运输方面最为严格的认证。疫苗的温度管理十分重要，机场将提高安全性和管理水平以备大量进口。
机场运营方和航空运输企业合作取得的是国际航空运输协会（IATA）的认证，作为能够以世界最高水平航空运输医药品的企业得到了认可。
运营关西机场的关西机场公司和运输企业在2019年6月获得了认证，之后该公司在2020年12月成立了探讨疫苗安全运输的组织，公关负责人表示“（疫苗运输）需要严密的温度管理和迅速的手续，将完善接纳体系”。
成田国际机场公司（NAA）也与2020年11月新获得认证的企业等携手合作，NAA负责人自信地表示“具备可高品质地保管医药品的体系获得了认可”。要获得认证，除接受关于医药品的处理及风险管理的IATA培训之外，还必须通过专门官的审核。据称也有尚未获得认证的合作企业，将在2021年以后取得认证。
2019年的财务省贸易统计显示，医药品进口额方面，成田机场约为15873亿日元（约合人民币998亿元），占全国贸易额（包括港口在内）一半以上，其次为关西机场。两座机场均在机场内设有医药品专用的温度管理设施，可能也将用于运送疫苗。
日本政府已与美国辉瑞及莫德纳、英国阿斯利康达成接受疫苗供应的基本协议或签订了合同。温度管理方面，辉瑞的疫苗需要在零下70度左右、莫德纳疫苗要在零下20度左右进行管理和保存。
