2012年，随着我国经济增长的回落，科技型中小微企业发展面临着复杂的国际国内环境。高新技术产品出口增速大幅下降，进出口增速继续低于同期总体进出口增速。国内消费增长较为缓慢。国际国内市场的双萎缩，对科技型中小微企业的生产经营活动产生重大影响。
科技型中小微企业的市场规模严重不足，导致盈利水平下降，投资意愿进一步收缩。有调查显示，长三角近7成小微企业经营受到订单下滑影响，超4成企业选择了主动收缩生产规模。另据2012年上半年高新技术企业景气调查表明，高新技术企业商品销售、销售价格、出口等重要景气指数均出现下降，且企业规模越小，景气下降幅度也相对越高。受此影响下，企业盈利景气指数回落明显，企业投资意愿进一步下降。
科技型中小微企业面临的有些困境不仅仅是受到经济大形势的影响，更是体现了市场自然淘汰、转移和整合的过程。例如，智能化手机的出现，导致功能手机制造商的利润空间严重缩水，2012年前8个月我国手机产量增速创历史新低，甚至远低于在经济危机爆发的2008、2009年的增长幅度。又如，受到美国等“双反”调查以及消费补贴下降的影响，赛维LDK等龙头企业甚至停产，导致为其配套的中小企业举步维艰。再如，产业向西部地区转移明显，客观上导致东部地区中小企业陷入困境。
有些困境受长期的、不可逆的因素影响。例如：中小企业贷款难一直是世界性难题。由于中小企业资质、信誉相对较差，缺乏银行认可的抵押物等，与大企业相比在贷款上历来就处于不利地位。另一方面，原材料、劳动力成本上升导致企业生产成本上升，部分劳动密集型中小企业的成本平均增加了20%—30%。
有些困境是企业和政府急需下大力气改革破解的问题。例如：中小微企业自身经营发展的缺损性、风险性和不确定性，而很多企业脱胎于大学、科研院所的技术发明人，缺乏经营管理和市场打拼经验。同时，新的技术、新的市场、新兴的行业等，都增加了科技型中小微企业经营的风险，在外因的诱使下，更加明显地暴露出来。又如：政府对科技型中小微企业的金融、税收、采购等政策支持，远远滞后于企业的需求。
加大对科技型中小微企业的支持力度，不仅要真正落实现有扶持政策，更为重要地是创新政策的工具和手段。过去，由于财力有限，我国创新政策以选择性政策为主，在技术领域上选择少数关键领域，在产业领域上选择大型企业。目前，我国经济实力显著提升，政策基础发生重大变化，应学习发达国家经验，调整政策工具，加大对科技型中小微企业的自主创新支持力度。例如：设立促进大学、科研院所服务中小微企业的专项计划；加大对科技型中小微企业产品采购力度；促进对中小企业的科技创新服务等等。
