2013年12月15日，杭甬运河历经周折全线贯通。一年后，在工业疲软、房地产不景气、基础设施建设放缓，社会经济整体慢行的情况下，其运行效益仍令人欣喜。
一是新坝船闸过闸运量呈大幅增长趋势。一年间，新坝船闸过闸船舶63935艘次、过闸总运量2191.9万吨、过闸货运量1352.7万吨，较上年同期均呈现较大幅度增长，分别为7.1%、18.4%、23.4%。另外由于杭甬运河全线贯通带来的石料需求格局调整，使得今年以来新坝船闸过闸空船数量有所下降，过闸船舶空载系数38.3%，同比下降2.5个百分点，船舶和船闸营运效率得以有效提升。
二是沿线企业所需原材料的水路运输途径更为通畅，煤炭、黄砂、石子等大宗适水运输货物运量持续增长，并且首次有农副产品、集装箱通过内河水路运输，杭甬运河的集装箱运输已初具雏形。这之中，位于绍兴越城区的绍兴港现代物流园，利用杭甬运河航道优势，着手开辟内河集装箱航线。通过集装箱从重庆寸滩码头上船，走长江干线直达上海港，再通过“水水中转”运达绍兴港。根据绍兴港现代物流园的统计数据，自集装箱首航至今，共通过集装箱船38艘次、627标箱、1.48万吨。
三是提高了运河沿线地区的可通达性，完善了区域综合交通运输体系，降低了货物运输成本，增强沿河地区的基础设施和开发区载体功能，产生了较大的产业集聚和辐射效应，形成基地型、龙头型重大产业项目，有力带动了沿河产业的发展。目前正在紧张建设中的铁路白鹿塘货场距离杭甬运河仅2公里，集中整合了杭州南（原萧山站）、萧山西、临浦站铁路货场和货运设施，建成后货场年运量将达到800万吨，远期运量达到1000万吨，专用线年运量为184万吨，远期年运量 216万吨，将成为杭州南部铁路货场物流枢纽中心。杭甬运河、03省道东复线、杭州绕城高速、白鹿塘货场共同组成该区域公铁水运输网络，形成三式联运格局，宜水则水，宜陆则陆，不同的运输方式的货物运输转换更加敏捷，为区域经济发展服务的优势得到进一步显现。
杭甬运河作为长江三角洲地区高等级航道网骨干航道之一，2009年试通航以来承担了杭州、绍兴地区大量适水货物的运输功能，为杭绍地区货物运输作出了积极贡献。随着其在2013年底的全线贯通，航道条件更加优越，船舶航行更加安全畅通，行业关注度也不断提升，其通航潜力正在逐步发挥，相信杭甬运河在未来将发挥更大的作用。
