2013年冬春航季于2013年10月27日开始，2014年3月29日结束，共5个月。南航货运在冬春季呈现出改善机队结构、优化航线网络、创新航班规划三大特点。本季货机将执行13条航线，平均32班/周，着力开发杭州、青岛、郑州、重庆四大航点，深化巩固在荷兰、德国、奥地利、加拿大、美国五大发达国家的市场地位。
南航货机机队规模为777货机8架。通过机队结构的变化，优化航班结构，缩短芝加哥回程浦东航线的航程时间。浦东始发芝加哥航线每周四班，其中周三、六去程经停郑州。浦东始发洛杉矶航线每周四班，采取直飞及回程经停温哥华串飞模式;广州始发洛杉矶航线每周三班，来回程通过经停国内青岛、杭州、郑州航点增加航班载运率。
冬春季南航货机将根据市场情况，满足市场需求，除航班的正班正常执飞外，南航货运计划在旺季每周加飞一班浦东—阿姆斯特丹—浦东直飞航班，同时，灵活调配运力执飞广州—杭州—洛杉矶—广州和广州—青岛—洛杉矶—郑州—广州联动航线。
对于欧洲市场，国内始发至阿姆斯特丹及法兰克福航线分别达每周12班和9班。浦东始发阿姆斯特丹航线每周六班，除直飞外通过经停维也纳和重庆完善航线网络结构;广州始发阿姆斯特丹航线每周六班，其中三班经停重庆，进一步提高重庆电子产品出货效率。法兰克福作为欧洲另一重要腹地，南航货运计划每周执行六班浦东始发法兰克福直飞航班，三班广州始发直飞航线。
此外，2014年计划新开通广州—浦东—洛杉矶—广州航线，进一步综合国内两大枢纽机场货源，完善航线网络。
2013年冬春季南航共执飞13条全货机航线，平均每周执飞32班，具体航线如下：
1、浦东—安克雷奇—芝加哥—浦东航线 每周两班
2、浦东—郑州—安克雷奇—芝加哥—浦东 每周两班
3、浦东—洛杉矶—温哥华—浦东航线 每周三班
4、浦东—洛杉矶-浦东直飞航线 每周一班
5、广州-青岛—洛杉矶—郑州—广州 每周两班
6、广州—杭州—洛杉矶—广州 每周一班
7、浦东—阿姆斯特丹—维也纳—浦东航线 每周三班
8、浦东—阿姆斯特丹—重庆—浦东航线 每周两班
9、浦东—阿姆斯特丹—浦东 每周一班
10、广州—重庆—阿姆斯特丹—广州 每周三班
11、广州—阿姆斯特丹—广州 每周三班
12、浦东—法兰克福—浦东 每周六班
13、广州—法兰克福—广州 每周三班
