2006年5月29日正式实施的日本“肯定列表制度”，给福建与日本的食品、农产品贸易蒙上一层浓厚的阴影，福建与日本食品、农产品贸易形势不容乐观。
日本“肯定列表制度”规定15种禁止使用农业化学品；对799种农药、兽药及饲料添加剂设定了总计5400多个残留限量标准，是原来的5.8倍；对没有设定限量标准的，将执行“一律标准”，即含量不得超过0.01毫克/千克，几乎为现有仪器的最低检测限。
而且检验周期加长、费用增加，导致通关速度减慢、出口成本大幅增加。
福建是中国输日食品、农产品大省，2005年福建出入境检验检疫局辖区出口输日食品、农产品32万吨，5.6亿美元。尤其是传统大宗产品茶叶、蔬菜、水产品(含烤鳗)输日货值所占比例较大，分别达四成多至五成多。
多年来，为向国际市场提供更为优质的农产品，福建不断强化源头管理，在实施出口水产品、鳗鱼、蔬菜养殖、种植基地备案基础上，开展出口茶叶种植基地备案，从源头消除药残隐患。福建检验检疫部门还专题开展茶叶、蔬菜、食用菌、鳗鱼及其它水产品的分析与控制研究，通过对现用药物品种与日本标准的比较，提出回避、限制和推荐使用药物品种，研究化学品合理使用指南和种植、养殖良好操作规范，为种植、养殖户提供有效指导。
为有效应对日本及欧盟等不断变化的标准要求，福建正积极推行初级农产品生产的良好农业规范(GAP)，通过对施肥、用药、用水等生产环节进行控制，从而有效预防农、兽药残留超标，保证原料的安全卫生。同时推行“公司+基地”的生产加工管理模式，加工企业与基地形成相对稳定、风险共担、质量共保、利益共享的有机整体，及时将国外标准要求告知种植、养殖户，有效掌握源头化学品使用情况。
目前，福建大宗农产品如茶叶、蔬菜、水产品主要出口市场都在日本，市场容量有限，竞争激烈，容易受到国外技术措施的影响，为降低出口风险，福建正鼓励企业进一步开拓多元化市场。
长期以来，福建食品、农产品以质优介廉享誉国际市场，苛刻的市场准入对贸易双方无疑是把双刃剑。
