近日，财政部、交通运输部、税务总局联合发布《关于海南自由贸易港国际运输船舶有关增值税政策的通知》（以下简称《通知》），明确对符合相应条件的国际运输船舶，实行增值税退税政策。
该通知自2020年10月1日起执行，至2024年12月31日。
按照《通知》，对境内建造船舶企业向运输企业销售，且同时符合购进船舶在“中国洋浦港”登记、购进船舶从事国际运输和港澳台运输业务这两项条件的船舶，实行增值税退税政策，由购进船舶的运输企业，向主管税务机关申请退税。
购进船舶运输企业的应退税额，为其购进船舶时支付的增值税额。
同时，《通知》还逐项列出了购进船舶的运输企业，向主管税务机关申请退税时应提供的资料；明确运输企业购进船舶支付的增值税额，已从销项税额中抵扣的，不得申请退税；已申请退税的，不得从销项税额中抵扣。
此外，运输企业不再符合该《通知》退税条件的，应向交通运输部门办理业务变更，并在条件变更次月纳税申报期内，向主管税务机关办理补缴已退税款手续。
其中，应补缴增值税额＝购进船舶的增值税专用发票注明的税额×（净值÷原值）。净值=原值－累计折旧。
运输企业按照上述规定补缴税款的，自税务机关取得解缴税款的完税凭证上注明的增值税额，准予从销项税额中抵扣。
