由于市场持续不景，台湾民航业者近期纷纷决定停飞部分岛内航线，以应对客源缺乏的窘境。
综合岛内媒体报道，继春节前立荣航空公司宣布将退出“台北－高雄”航线后，远东航空公司日前又宣布将停飞“台北－台南”及“高雄－花莲”航线，华信航空公司则将停飞“台中－台东”航线。
根据有关机构的统计，2001年至2007年，岛内航线班次平均每年减少7.6％。特别是2007年1月台湾高速铁路通车以后，2007年1至10月，岛内航线旅客量比上年同期大幅衰退25.3％。
有业者认为，如果未来1年内仍无法全面开放两岸“三通”，或大幅增加两岸包机航班及班次，在高铁不断增加班次的情况下，岛内西部航线将全部失去市场，甚至连花莲、台东等东部航线也将告急，“到时候，航空公司已经不是合并的问题，而是倒闭”。
据台湾《中国时报》报道，出于对两岸“三通”的期盼，岛内航空业者一度大量购入飞机，但“三通”迟迟不开放加上岛内航空市场不景气，现在岛内民航业境况凄惨，航空公司倒闭、合并的传闻不断，有的只能靠卖飞机来勉强维持营运。
因经营困难，远东航空公司最近已发生财务危机。据媒体报道，该公司短短几天中遭到退票的支票金额累计达到3750万元新台币，资金缺口相当严重。
不仅航空公司生存困难，岛内机场近几年也是艰难度日。最新公布的统计显示，岛内现有18处民用机场中，只有桃园、高雄两座国际机场有盈利，其他皆亏损。
业者普遍认为，只有尽快全面开放两岸“三通”，岛内民航业才有可能“走出寒冬”。
